《伽利略：禁忌魔法》讲述的是《无声游行》四年前发生的事件。侦探草薙俊平和他的部下牧村智香拜访帝都大学副教授汤川。被谋杀的自由撰稿人长冈修的房间里发现了一段奇怪的视频文件，视频显示仓库的墙壁上突然出现了一个洞。汤川对这段视频异常感兴趣。 “请带我去拍摄这段视频的地点。”汤川说道。草薙一边担心他的异常行为，一边与牧村一起前往现场。